Docusalut s'estructura en Comunitats i Col·leccions.
Les Comunitats són les diferents organitzacions que formen part del sistema sanitari públic de les Illes Balears. Les podem veure a la plana d'inici del repositori amb la indicació del nombre de documents disponibles de cada una.

i les col·leccions sempre són 6 i es troben dins d'aquestes 12 comunitats. Per exemple, aquí teniu la d'Atenció Primària de Mallorca

Trobareu sempre les mateixes 6 col·leccions de documents a cada comunitat. Tot i que la informació que hi haurà a dintre serà diferent ja que correspondrà a la institució de la comunitat a la qual pertany la col·lecció.
Un document pot estar a més d'una col·lecció si s'ha fet en col·laboració entre dos o més organitzacions. Per exemple, aquest pòster:
Segons el tipus de document digital i a qui va adreçat l'haureu de dipositar a una col·lecció o a una altra de la vostra institució. Aquí teniu una petita de guia per saber a quina col·lecció heu de dimpositar el vostre document:
| Col·lecció | Tipus de document | A qui s'adreça |
| Comunicació científica | articles científics, pòsters, comunicacions a congressos, etc. | A tothom |
| Dades d'investigació | datasets | A tothom |
| Divulgació | fulletons, cartells, infografies, díptics, etc. | A la ciutadanía |
| Docència | presentacions de sessions, apunts de cursos, etc | Als professionals que treballen a la institució |
| Pràctica clínica | guies, programes, protocols oficials, etc. | Als professionals sanitaris que treballen a la institució |
| Publicacions institucionals |
memòries, plans estratègics, informes, etc. | Als professionals de la institució, a altres organitzacions del sistema sanitari públic de les Illes Balears i a altres institucions superiors o relacionades. |


